ตราสัญลักษณ์มหาวิทยาลัยนครพนม มีลักษณะเป็นรูปหยดน้ำสีน้ำตาล ประกอบด้วย องค์พระธาตุพนมอยู่บนดอกบัว ส่วนล่างขององค์พระธาตุพนมมีซุ้มประตูสี่ทิศบนคลื่น น้ำสีฟ้าจำนวนสามเส้น ภายในองค์พระธาตุพนมเป็นลายดอกบัวเจ็ดดอก โดยทั้งหมดอยู่ในวงรีลักษณะ หยดน้ำและภายในมีวงรีสีเหลืองทองสองวง ระหว่างวงรีสีเหลืองทองมีรูปรวงข้าวสีเหลืองทองทั้งสองข้าง เล่ม ๑๒๔ ตอนที่ ๘๙ ก ส่วนล่างของตราสัญลักษณ์เป็นรูปฐานสิงห์สีน้ำตาลดัดโค้งตามรูปหยดน้ำ ด้านใต้เป็นชื่อมหาวิทยาลัย ภาษาไทยว่า “มหาวิทยาลัยนครพนม” และมีชื่อภาษาอังกฤษว่า “NAKHONPHANOMUNIVERSITY”